| Unidade USP | Grande área CAPES | Nome do Programa |
| ESALQ | Ciências Agrárias | Genética e Melhoramento de Plantas |
| FCF | Ciências Agrárias | Ciência dos Alimentos |
| FMVZ | Ciências Agrárias | Anatomia dos Animais Domésticos e Silvestres |
| ESALQ | Ciências Agrárias | Internacional de Biologia Celular e Molecular Vegetal |
| ESALQ | Ciências Agrárias | Genética e Melhoramento de Plantas |
| ICB | Ciências Biológicas | Ciências Biológicas (Microbiologia) |
| IB | Ciências Biológicas | Botânica |
| IQ | Ciências Biológicas | Ciências Biológicas (Bioquímica) |
| ICB | Ciências Biológicas | Imunologia |
| ICB | Ciências Biológicas | Biologia da Relação Patógeno-Hospedeiro |
| FFCLRP | Ciências Biológicas | Biologia Comparada |
| ICB | Ciências Biológicas | Fisiologia Humana |
| FCFRP | Ciências da Saúde | Biociências Aplicadas à Farmácia |
| FMRP | Ciências da Saúde | Saúde da Criança e do Adolescente |
| FCF | Ciências da Saúde | Tecnologia Bioquímico-Farmacêutica |
| FM | Ciências da Saúde | Psiquiatria |
| FM | Ciências da Saúde | Medicina Preventiva |
| FCFRP | Ciências da Saúde | Ciências Farmacêuticas |
| FFCLRP | Ciências Exatas | Química |
| IQSC | Ciências Exatas | Química |
| IME | Ciências Exatas | Matemática Aplicada |
| IME | Ciências Exatas | Matemática |
| IFSC | Ciências Exatas | Física |
| IF | Ciências Exatas | Física |
| IQ | Ciências Exatas | Química |
| FFCLRP | Ciências Humanas | Psicobiologia |
| IP | Ciências Humanas | Psicologia Clínica |
| EESC | Engenharias | Engenharia de Produção |
| IPEN | Engenharias | Tecnologia Nuclear |
| EESC | Engenharias | Hydraulics & Sanitary Engineering |
| EEL | Engenharias | Engenharia de Materiais |
| EESC | Engenharias | Engenharia Elétrica |
| EP | Engenharias | Engenhariam Mecânica |
GRE Programs
| Psicologia Clínica |
