O programa de pós-graduação em Zootecnia oferece cursos em nível de mestrado (desde 1994) e doutorado (desde 2001), contribuindo para a formação técnica, científica e social de alunos brasileiros e estrangeiros. 

O programa é composto por um grupo de pesquisadores que possuem formação multidisciplinar, que atuam em diferentes áreas relacionadas a Zootecnia, tais como:

• Ciências Básicas aplicadas a Zootecnia;
• Melhoramento Genético e Reprodução Animal;
• Nutrição e Produção Animal;
• Etologia, Bioclimatologia, Construções Rurais e Ambiência;
• Produção e Tecnologia de Alimentos;
• Produção e Manejo de Plantas Forrageiras e Pastagens.

As pesquisas realizadas pelos membros do programa são desenvolvidas com o apoio de instituições públicas e privadas e têm gerado contribuições de grande relevância para os diferentes segmentos da agropecuária. O programa de Pós-Graduação também possui uma grande interação com universidades e centros de pesquisa do Brasil e do exterior, que possibilita aos seus estudantes uma formação completa sobre temas de relevância internacional, relacionados ao ensino, pesquisa e ao desenvolvimento e aplicação de soluções para toda a cadeia da produção animal.