O Programa de Pós-Graduação em Medicina Tropical do Instituto de Medicina Tropical de São Paulo teve a autorização de sua criação pelo Conselho de Pós-Graduação da Universidade de São Paulo em 20/12/2006, publicado no Diário Oficial do Estado de São Paulo e a recomendação da CAPES (Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior), através de seu Conselho Técnico Científico reunido entre o período de 23 a 25 de julho de 2007, atribuindo nota 05 ao Programa.

O programa possui uma área de concentração  - Medicina Tropical e Saúde Internacional.

Linhas de pesquisa

• Mecanismos de interação patógeno-hospedeiro em doenças tropicais e saúde internacional
• Métodos sorológicos, biológicos e moleculares no contexto das doenças tropicais e saúde internacional
• Epidemiologia e controle em doenças tropicais e saúde internacional
• Estudo da diversidade de patógenos e hospedeiros, no contexto das doenças tropicais e saúde internacional

Atualmente, pouco mais de 20 orientadores plenos atuam no programa, todos bastante produtivos (70% são bolsistas de produtividade em pesquisa do CNPq), com grande número de citações e publicações em revistas importantes para a área de conhecimento. 

O objetivo do programa é formar recursos humanos especializados em ensino e pesquisa na área de Doenças Tropicais e Saúde Internacional que atuarão em instituições de ensino superior, tanto públicas quanto privadas, centros de pesquisa e também na área de políticas públicas de saúde.