O Programa de Pós-Graduação em Ciências Biológicas - Bioquímica do Instituto de Química da USP iniciou-se em 1970, com o objetivo central de unir a pesquisa na fronteira do conhecimento em Bioquímica e Biologia Molecular e a formação de pesquisadores pós-graduados bem qualificados, competentes e capazes de desenvolver linhas de pesquisa independentes e inovadoras.

É um programa de excelência em sua área, sendo avaliado pela CAPES com conceito máximo desde que o sistema brasileiro de avaliação de pós-graduação foi implantado. 

O programa inclui atualmente um corpo de 39 orientadores. Grande parte desses orientadores integra o corpo docente do Departamento de Bioquímica, do Instituto de Química da USP. O programa também inclui orientadores plenos do Instituto Butantan e Instituto Ludwig de Pesquisa sobre o Câncer. Esses pesquisadores trabalham em um conjunto diverso de projetos de pesquisas relevantes nas áreas de Bioquímica e Biologia Molecular.

Estudantes provindos de diversos cursos de graduação e universidades distintas ingressam nos cursos de Mestrado, Doutorado ou Doutorado Direto através do Exame de Ingresso. Após o ingresso os estudantes realizam disciplinas e desenvolvem projetos de pós-graduação em laboratórios especializados, sob orientação de docentes credenciados.